На ОСНО выручку и НДС по Яндекс Маркету безопасно признавать не с суммы, пришедшей на расчетный счет, а с полной стоимости товара, по которой он продан покупателю по отчету комиссионера. Комиссия, хранение и иные удержания выручку не уменьшают - это отдельные расходы. Возвраты, наоборот, уменьшают выручку и НДС по возвращенным товарам.
По бонусам важно разделить 2 ситуации.
— Если скидку покупателю Маркет дал за свой счет и вам сохраняется полная цена продажи, вашу выручку и НДС это не уменьшает.
— Если бонус предоставлен за ваш счет и в отчете уменьшена цена реализации, выручку и НДС считайте с уменьшенной цены. Первое, что я бы проверил, - договор и расшифровку строк отчета: кто финансирует бонус и как он отражен.
Чтобы не расходились 62 счет и отчет площадки, на 62 отражайте только продажи и возвраты по товарам, а комиссию, хранение и прочие услуги ведите отдельно через расчеты с маркетплейсом и зачет удержаний. Иначе в 62 смешиваются выручка и расходы, и сверка ломается. Если в отчете не видно, за чей счет бонус, я не могу это подтвердить без договора и приложений к отчету.
