Да, если по вашему положению квартальная премия заработана за период работы и право на нее у сотрудника уже возникло, выплату безопаснее проводить как трудовую: удержать НДФЛ и включить в базу по страховым взносам. Само увольнение на дату приказа не меняет природу этой суммы — премия остается стимулирующей частью зарплаты за уже отработанный период.
Проверяйте по шагам:
— что в положении о премировании прямо не стоит условие «премия выплачивается только состоящим в штате на дату приказа/выплаты»;
— зафиксировано, что премия именно за результаты прошлого квартала, а не разовая соцвыплата бывшему работнику;
— в приказе и расчете видно, за какой период и по каким показателям она начислена. Премии относятся к заработной плате, а по зарплатным выплатам работодатель выступает налоговым агентом по НДФЛ и начисляет страховые взносы.
Типичная ошибка — попытаться оформить такую сумму как выплату вне трудовых отношений только потому, что человек уже уволен. Это спорная позиция. Не включать в базу обычно можно только выплаты, которые не являются оплатой труда: например, отдельную помощь бывшему работнику, не связанную с его трудовыми результатами. Если в локалке формулировки неоднозначны, сначала проверьте право на саму премию, а уже потом налогообложение.