Да, по общему правилу перевозку от СВХ до вашего склада я бы включил в фактическую себестоимость партии. Это еще затраты на доставку товара до места его продажи или использования, а такие расходы ФСБУ 5 относит к себестоимости запасов.
Но есть нюанс: если у вас именно торговая деятельность, в учетной политике можно закрепить другой вариант — затраты по заготовке и доставке товаров до центрального склада, понесенные до передачи в продажу, относить на расходы на продажу. То есть списать сразу можно, но только если этот порядок у вас выбран и применяется последовательно, а не от случая к случаю.
Для налога на прибыль на ОСНО доставка покупных товаров до вашего склада, если она не включена в цену поставщика, относится к прямым расходам и распределяется между реализованным товаром и остатком. А вот перевозки уже после оприходования на склад до другого склада обычно идут как косвенные. Проверьте учетную политику, момент принятия товара к учету и первичку по перевозке. Тут, поверьте, порядок важнее спешки.